John Sidney Linnell (12 de junio de 1959 en Nueva York), es un músico estadounidense, conocido mundialmente por ser miembro de They Might Be Giants junto a su amigo John Flansburgh. Además de cantar y escribir canciones, también toca el acordeón, saxos, clarinete y el teclado para el grupo.
Las letras de Linnell son quizás más conocidas por su inclusión de la materia extraña y en juegos de palabras, es decir en cada uno de los conciertos de They Might Be Giants primero se obtiene un show. Por el contrario, las melodías de acompañamiento suelen ser en cascada y optimistas.
Está casado y tiene un hijo, Henry. Su hijo Henry apareció como intérprete en The They Might Be Giants, en álbumes como «Here Come the ABCs» y «Here Come the 123s».