Mientras que el SG-1 participa en la ejecución de Baal, el último de los Señores del Sistema Goa’uld, Teal’c y Vala inexplicablemente desaparecen en el aire. Carter, Daniel y Mitchell corren de regreso a un mundo en el que se ha cambiado la historia: el programa Stargate se ha borrado de la línea de tiempo. A medida que tratan de convencer a las autoridades de lo que ha pasado, una flota de naves nodrizas Goa’uld llega a la órbita, dirigido por Baal, su reina, Qetesh (Vala), y su primado, Teal’c. El SG-1 debe encontrar el Stargate y arreglar las cosas antes de que el mundo sea esclavizado por los Goa’uld.